CurrentControlSetサブキーは、実際のControlSetを含んでいません。
CurrentControlSetサブキーに現れる副キーと項目は、ControlSet001等の番号付のControlSetの1つのコンテンツです。
CurrentControlSetに現れるControlSetは、システムのスタートアップによって選択されて、SelectサブキーのCurrentの値によって確認されます。
例えば、ControlSet001の内容は、Currentの値が1ならば、CurrentControlSetに現れます。
HKEY_LOCAL_MACHINE/SYSTEM/Select/Current